Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPINK4O60575 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms