Protein–RNA interactions for Protein: O15226

NKRF, NF-kappa-B-repressing factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKRFO15226 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.746e-6■■□□□ 11.7
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NKRFO15226 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.626e-6■■□□□ 11.7
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NKRFO15226 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.46e-6■■□□□ 11.7
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NKRFO15226 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.186e-6■■□□□ 11.7
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NKRFO15226 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.341e-8■■□□□ 11.6
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NKRFO15226 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-7■■□□□ 11.6
NKRFO15226 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-7■■□□□ 11.6
NKRFO15226 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-7■■□□□ 11.6
NKRFO15226 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-7■■□□□ 11.6
NKRFO15226 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-7■■□□□ 11.6
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NKRFO15226 UBE3A-208ENST00000625681 654 ntTSL 526.57■■□□□ 1.842e-13■■□□□ 11.6
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NKRFO15226 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-13■■□□□ 11.6
NKRFO15226 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-13■■□□□ 11.6
NKRFO15226 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-13■■□□□ 11.6
NKRFO15226 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.072e-13■■□□□ 11.6
NKRFO15226 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-13■■□□□ 11.6
NKRFO15226 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-13■■□□□ 11.6
NKRFO15226 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-13■■□□□ 11.6
NKRFO15226 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-13■■□□□ 11.6
NKRFO15226 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-13■■□□□ 11.6
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