Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIZ1Q9ULV3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIZ1Q9ULV3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms