Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms