Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD4LQ96PU5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms