Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms