Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF3C6Q969F1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms