Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8AQ8IWT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8AQ8IWT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms