Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARA3Q6AZY7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms