Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms