Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSRP2Q16527 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CSRP2Q16527 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSRP2Q16527 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms