Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USF2Q15853 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USF2Q15853 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USF2Q15853 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USF2Q15853 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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