Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ZNHIT3Q15649 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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