Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 55.66□□□□□ -1.57e-10■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 SRPK2-208ENST00000474770 872 ntTSL 34.37□□□□□ -1.717e-10■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 SRPK2-205ENST00000465072 954 ntTSL 53.62□□□□□ -1.837e-10■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 33.6□□□□□ -1.837e-10■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.694e-10■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 FBRS-204ENST00000482749 725 ntTSL 513.7□□□□□ -0.224e-11■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 34.7
PCBP2Q15366 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 ACLY-205ENST00000588547 471 ntTSL 38.87□□□□□ -0.991e-12■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.581e-16■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 IRF3-214ENST00000596788 447 ntTSL 320.22■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 IRF3-210ENST00000595240 567 ntTSL 214.99□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 37.01□□□□□ -1.295e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-203ENST00000422098 390 ntTSL 423.02■■□□□ 1.283e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-207ENST00000468691 764 ntTSL 518.04■□□□□ 0.483e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-210ENST00000497640 533 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.373e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-211ENST00000497906 495 ntTSL 515.3■□□□□ 0.043e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-208ENST00000481776 598 ntTSL 514.65□□□□□ -0.063e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.973e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.093e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.433e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 XIAP-204ENST00000430625 528 ntTSL 33.09□□□□□ -1.913e-30■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.037e-9■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 VAT1-209ENST00000592388 478 ntTSL 56.99□□□□□ -1.297e-9■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.887e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 317.09■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 417.09■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 414.72□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 33.06□□□□□ -1.929e-7■■■■■ 34.6
PCBP2Q15366 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 513.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 211.46□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 516.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.09□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 DIAPH1-213ENST00000523100 1180 ntTSL 522.6■■□□□ 1.218e-13■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.361e-31■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.461e-31■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.431e-31■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-31■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 DDX42-212ENST00000581135 589 ntTSL 415.52■□□□□ 0.081e-31■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 24.78□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 IREB2-208ENST00000560440 4396 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.991e-19■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 IREB2-203ENST00000558570 2917 ntTSL 1 (best)5.1□□□□□ -1.591e-19■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 PDE4D-214ENST00000506024 599 ntTSL 44.02□□□□□ -1.773e-7■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 ARHGAP26-203ENST00000378013 564 ntTSL 45.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 34.5
PCBP2Q15366 MAP1B-205ENST00000512974 580 ntTSL 418.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 MAP1B-206ENST00000513526 2154 ntTSL 215.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 MAP1B-204ENST00000511641 2056 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 MAD1L1-213ENST00000455998 557 ntTSL 419.02■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.74□□□□□ -2.299e-10■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.57e-24■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.317e-24■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 216.53■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 DAPK1-217ENST00000496522 579 ntTSL 215□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 DAPK1-210ENST00000472344 548 ntTSL 513.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 34.4
PCBP2Q15366 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ATP6V1F-202ENST00000492758 711 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.165e-12■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 B3GNTL1-210ENST00000573629 423 ntTSL 38.76□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.525e-11■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SNAPC4-202ENST00000637388 1398 ntTSL 513.44□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CHRNB1-203ENST00000570557 947 ntTSL 512.27□□□□□ -0.455e-11■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CHRNB1-202ENST00000536404 1623 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.625e-11■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.845e-11■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CHRNB1-205ENST00000573209 2394 ntTSL 29.74□□□□□ -0.855e-11■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ZNF195-220ENST00000528796 881 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.067e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DLG4-209ENST00000491753 869 ntTSL 213.41□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.028e-7■■■■■ 34.3
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 398.1 ms