Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNB1Q14721 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNB1Q14721 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms