Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIGQ13278 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIGQ13278 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIGQ13278 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIGQ13278 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIGQ13278 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIGQ13278 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms