Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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