Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC5P78333 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC5P78333 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC5P78333 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC5P78333 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC5P78333 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC5P78333 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC5P78333 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC5P78333 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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