Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6V1E1P36543 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms