Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGS1P23219 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms