Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN1P12814 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ACTN1P12814 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms