Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 DENND1B-205ENST00000422998 583 ntTSL 319.46■□□□□ 0.714e-8■■■■■ 156.7
SF3B1O75533 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.841e-7■■■■■ 156.6
SF3B1O75533 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 156.6
SF3B1O75533 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 156.6
SF3B1O75533 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 156.6
SF3B1O75533 CTSD-203ENST00000429746 690 ntTSL 318.94■□□□□ 0.625e-10■■■■■ 156.5
SF3B1O75533 CTSD-214ENST00000637937 1262 ntTSL 518.6■□□□□ 0.575e-10■■■■■ 156.5
SF3B1O75533 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 FRYL-203ENST00000502520 441 ntTSL 219.81■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 FRYL-219ENST00000515684 465 ntTSL 318.17■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 FRYL-218ENST00000514783 2031 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-223ENST00000588516 1304 ntTSL 514.52□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-232ENST00000591579 144 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-233ENST00000591989 233 ntTSL 313.54□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-218ENST00000587547 889 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-211ENST00000585363 241 ntTSL 56.39□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-236ENST00000592846 484 ntTSL 45.99□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-231ENST00000590694 165 ntTSL 54.29□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 FRYL-212ENST00000509886 692 ntTSL 1 (best)3.97□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 FRYL-207ENST00000505437 443 ntTSL 32.36□□□□□ -2.033e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 NEDD4L-212ENST00000585594 220 ntTSL 1 (best)1.66□□□□□ -2.143e-6■■■■■ 156.3
SF3B1O75533 TBC1D22A-211ENST00000496139 530 ntTSL 422.95■■□□□ 1.264e-8■■■■■ 156.2
SF3B1O75533 TBC1D22A-208ENST00000441936 590 ntTSL 422.91■■□□□ 1.264e-8■■■■■ 156.2
SF3B1O75533 TBC1D22A-210ENST00000486163 513 ntTSL 422.56■■□□□ 1.24e-8■■■■■ 156.2
SF3B1O75533 TBC1D22A-209ENST00000472791 558 ntTSL 418.34■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 156.2
SF3B1O75533 AC068580.4-204ENST00000427721 1007 ntTSL 217.57■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 156
SF3B1O75533 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 156
SF3B1O75533 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 156
SF3B1O75533 UBXN7-202ENST00000381887 375 ntTSL 33.24□□□□□ -1.894e-6■■■■■ 156
SF3B1O75533 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 156
SF3B1O75533 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 156
SF3B1O75533 DAAM1-203ENST00000553307 1430 ntTSL 27.21□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 156
SF3B1O75533 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 156
SF3B1O75533 DAAM1-205ENST00000553966 1864 ntTSL 23.77□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 156
SF3B1O75533 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 155.9
SF3B1O75533 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 155.9
SF3B1O75533 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 155.9
SF3B1O75533 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 155.9
SF3B1O75533 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 155.9
SF3B1O75533 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 155.9
SF3B1O75533 EPS15L1-204ENST00000592031 2788 ntTSL 211.79□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 155.9
SF3B1O75533 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 155.9
SF3B1O75533 LRRC8C-203ENST00000479252 2993 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 155.8
SF3B1O75533 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 155.8
SF3B1O75533 GK5-207ENST00000472759 546 ntTSL 424.93■■□□□ 1.586e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 GK5-211ENST00000489085 568 ntTSL 424.93■■□□□ 1.586e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 GK5-210ENST00000487672 1103 ntTSL 1 (best)23.47■■□□□ 1.356e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 GK5-206ENST00000466685 801 ntTSL 318.3■□□□□ 0.526e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 GK5-203ENST00000460544 744 ntTSL 316.82■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 GK5-212ENST00000492097 3049 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 GK5-208ENST00000480757 4479 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 GK5-201ENST00000392993 9837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.786e-8■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.973e-9■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.063e-9■■■■■ 155.7
SF3B1O75533 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 155.6
SF3B1O75533 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 522.31■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 155.6
SF3B1O75533 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 319.17■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 155.6
SF3B1O75533 CD81-210ENST00000493525 396 ntTSL 516.56■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 155.6
SF3B1O75533 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 414.89□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 155.6
SF3B1O75533 MIR548XHG-202ENST00000414582 615 ntTSL 37.43□□□□□ -1.227e-7■■■■■ 155.5
SF3B1O75533 PTDSS2-203ENST00000525727 837 ntTSL 1 (best)23.11■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 155.2
SF3B1O75533 PTDSS2-207ENST00000527479 520 ntTSL 522.7■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 155.2
SF3B1O75533 PTDSS2-212ENST00000531520 890 ntTSL 320.54■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 155.2
SF3B1O75533 PTDSS2-213ENST00000532614 437 ntTSL 314.52□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 155.2
SF3B1O75533 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 533.29■■■□□ 2.922e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.432e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.983e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 NR2F6-202ENST00000596878 731 ntTSL 327.31■■□□□ 1.968e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ATP6AP1-203ENST00000429585 769 ntTSL 527.06■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MIB2-211ENST00000483015 1058 ntTSL 326.87■■□□□ 1.896e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.793e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.778e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.722e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MIB2-205ENST00000464570 968 ntTSL 325.75■■□□□ 1.716e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ATP6AP1-206ENST00000449556 720 ntTSL 525.13■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AP000347.1-208ENST00000444220 618 ntTSL 424.97■■□□□ 1.598e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MIB2-208ENST00000473511 1332 ntTSL 524.96■■□□□ 1.596e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.446e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.48e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.286e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MNT-204ENST00000572892 556 ntTSL 422.75■■□□□ 1.236e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SH2D3A-204ENST00000595681 1750 ntTSL 522.62■■□□□ 1.216e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CORO7-207ENST00000571059 581 ntTSL 322.45■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MBOAT7-204ENST00000414665 876 ntTSL 222.39■■□□□ 1.188e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.166e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.156e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.158e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-222ENST00000637667 874 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.138e-9■■■■■ 155.1
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1337.1 ms