Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCE3A1L190 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms