Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEC2Q9UBF1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC2Q9UBF1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms