Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms