Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms