Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD2AQ9BW72 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms