Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms