Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP3Q96JB5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms