Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPCDCQ96CD2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPCDCQ96CD2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms