Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA10Q969M2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA10Q969M2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms