Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF3Q5VWG9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms