Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDO1Q16878 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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