Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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GBX1Q14549 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX1Q14549 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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