Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME3Q13232 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME3Q13232 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NME3Q13232 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NME3Q13232 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME3Q13232 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME3Q13232 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
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