Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP4Q13115 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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