Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 YDL180WYDL180W 1644 nt3.44□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 ATP25YMR098C 1839 nt3.44□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YSW1YBR148W 1830 nt3.44□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YJL202CYJL202C 348 nt3.44□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 UTP30YKR060W 825 nt3.44□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YLR031WYLR031W 561 nt3.44□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 RPL22AYLR061W 366 nt3.44□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 KRE5YOR336W 4098 nt3.44□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 SPC72YAL047C 1869 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 SLP1YOR154W 1764 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YGR237CYGR237C 2358 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 GEP4YHR100C 558 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YJR023CYJR023C 402 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YKL111CYKL111C 336 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 SHE2YKL130C 741 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 IMP4YNL075W 873 nt3.43□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 MUS81YDR386W 1899 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 MSL1YIR009W 336 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 TMA19YKL056C 504 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 MYO3YKL129C 3819 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 RPB11YOL005C 363 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YPR053CYPR053C 456 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 SSM4YIL030C 3960 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 UBP5YER144C 2418 nt3.42□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 FAS1YKL182W 6156 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 RAD26YJR035W 3258 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 VPS53YJL029C 2469 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 IRC4YDR540C 540 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 RPC10YHR143W-A 213 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 LSM1YJL124C 519 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 PAU23YLR037C 375 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 SSN8YNL025C 972 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 RPL23AYBL087C 414 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YBR137WYBR137W 540 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 YDL176WYDL176W 2127 nt3.41□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 DPB11YJL090C 2295 nt3.4□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 CIN1YOR349W 3045 nt3.4□□□□□ -1.86
UPC2Q12151 SNX41YDR425W 1878 nt3.4□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 RMT2YDR465C 1239 nt3.4□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 FMP32YFL046W 624 nt3.4□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 BCD1YHR040W 1101 nt3.4□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 ISF1YMR081C 1017 nt3.4□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 RPS8AYBL072C 603 nt3.4□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 NDD1YOR372C 1665 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 RNR1YER070W 2667 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 TIF35YDR429C 825 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 PEX11YOL147C 711 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YPL238CYPL238C 390 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YOP1YPR028W 543 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 MDM32YOR147W 1869 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 SHQ1YIL104C 1524 nt3.39□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 GPI13YLL031C 3054 nt3.38□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 RSC1YGR056W 2787 nt3.38□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 CAJ1YER048C 1176 nt3.38□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 HMF1YER057C 390 nt3.38□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.38□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 SRL3YKR091W 741 nt3.38□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 JIP5YPR169W 1479 nt3.38□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 NUP60YAR002W 1620 nt3.37□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 ATG21YPL100W 1491 nt3.37□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 FCF2YLR051C 654 nt3.37□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 HEM4YOR278W 828 nt3.37□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 FAA2YER015W 2235 nt3.37□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 SEC15YGL233W 2733 nt3.37□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 SYT1YPR095C 3681 nt3.37□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 RAD4YER162C 2265 nt3.37□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 XRN1YGL173C 4587 nt3.36□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 PGA1YNL158W 597 nt3.36□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 ARK1YNL020C 1917 nt3.36□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 RAD2YGR258C 3096 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 NUP159YIL115C 4383 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 URM1YIL008W 300 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 PRE8YML092C 753 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 RSM19YNR037C 276 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YPR077CYPR077C 372 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 BYE1YKL005C 1785 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 XRS2YDR369C 2565 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 KHA1YJL094C 2622 nt3.35□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 RPA135YPR010C 3612 nt3.34□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 PHO81YGR233C 3537 nt3.34□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 CWC22YGR278W 1734 nt3.34□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 BAT1YHR208W 1182 nt3.34□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YJL015CYJL015C 285 nt3.34□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 IRC23YOR044W 474 nt3.34□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 EGD1YPL037C 474 nt3.34□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt3.34□□□□□ -1.87
UPC2Q12151 DNM1YLL001W 2274 nt3.33□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 NOT5YPR072W 1683 nt3.33□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 SNF12YNR023W 1701 nt3.33□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YBP1YBR216C 2025 nt3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms