RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
XRS2	YDR369C	INO80	P53115	1489 aa		5.74	□□□□□ -1.49
XRS2	YDR369C	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
XRS2	YDR369C	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
XRS2	YDR369C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
XRS2	YDR369C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
XRS2	YDR369C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		5.47	□□□□□ -1.53
XRS2	YDR369C	SGS1	P35187	1447 aa		5.46	□□□□□ -1.54
XRS2	YDR369C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
XRS2	YDR369C	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
XRS2	YDR369C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
XRS2	YDR369C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
XRS2	YDR369C	FAP1	P53971	965 aa		5.29	□□□□□ -1.56
XRS2	YDR369C	SWR1	Q05471	1514 aa		5.28	□□□□□ -1.56
XRS2	YDR369C	KOG1	P38873	1557 aa		5.23	□□□□□ -1.57
XRS2	YDR369C	HSL1	P34244	1518 aa		5.23	□□□□□ -1.57
XRS2	YDR369C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
XRS2	YDR369C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
XRS2	YDR369C	CAB3	P36076	571 aa		5.19	□□□□□ -1.58
XRS2	YDR369C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
XRS2	YDR369C	SSN2	P38931	1420 aa		5.19	□□□□□ -1.58
XRS2	YDR369C	SIN3	P22579	1536 aa		5.19	□□□□□ -1.58
XRS2	YDR369C	HIR3	P47171	1648 aa		5.12	□□□□□ -1.59
XRS2	YDR369C	SIS2	P36024	562 aa		5.1	□□□□□ -1.59
XRS2	YDR369C	SSK2	P53599	1579 aa		5.09	□□□□□ -1.6
XRS2	YDR369C	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
XRS2	YDR369C	TAF7	Q05021	590 aa		5.06	□□□□□ -1.6
XRS2	YDR369C	DNA2	P38859	1522 aa		5.05	□□□□□ -1.6
XRS2	YDR369C	BUD4	P47136	1447 aa		5.02	□□□□□ -1.61
XRS2	YDR369C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
XRS2	YDR369C	REV3	P14284	1504 aa		5.01	□□□□□ -1.61
XRS2	YDR369C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
XRS2	YDR369C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	YDR369C	PRY3	P47033	881 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	YDR369C	PEP1	P32319	1579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	YDR369C	ATG2	P53855	1592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XRS2	YDR369C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	YDR369C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	YDR369C	CHD1	P32657	1468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	YDR369C	YPR148C	Q06523	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	YDR369C	MDS3	P53094	1487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	YDR369C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
XRS2	YDR369C	RPO31	P04051	1460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
XRS2	YDR369C	POL1	P13382	1468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
XRS2	YDR369C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
XRS2	YDR369C	TFA1	P36100	482 aa		4.84	□□□□□ -1.63
XRS2	YDR369C	TAF2	P23255	1407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
XRS2	YDR369C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
XRS2	YDR369C	AVT3	P36062	692 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	MYO4	P32492	1471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	TCB2	P48231	1178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	STU1	P38198	1513 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	YOR1	P53049	1477 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	YTA7	P40340	1379 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XRS2	YDR369C	BPT1	P14772	1559 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XRS2	YDR369C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
XRS2	YDR369C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
XRS2	YDR369C	MNN4	P36044	1178 aa		4.73	□□□□□ -1.65
XRS2	YDR369C	RKR1	Q04781	1562 aa		4.73	□□□□□ -1.65
XRS2	YDR369C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
XRS2	YDR369C	RLF2	Q12495	606 aa		4.71	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	MET5	P47169	1442 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	CDC25	P04821	1589 aa		4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.69	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	QCR6	P00127	147 aa		4.69	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	UFD4	P33202	1483 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
XRS2	YDR369C	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.6 ms