Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms