Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms