Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NMUP48645 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NMUP48645 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NMUP48645 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NMUP48645 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms