Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms