Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHTOPQ9Y3Y2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms