Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FANCIQ9NVI1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCIQ9NVI1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCIQ9NVI1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCIQ9NVI1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCIQ9NVI1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCIQ9NVI1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCIQ9NVI1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCIQ9NVI1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCIQ9NVI1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCIQ9NVI1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms