Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms