Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A3Q9HAS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms