Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCOLN1Q9GZU1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN1Q9GZU1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms