Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HIRIP3Q9BW71 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms