Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms