Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TPD52L3Q96J77 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TPD52L3Q96J77 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms